安捷伦科技推出用于新一代测序靶向序列捕获系统的最新定制试剂盒

2011年06月30日 11:06    Liming
关键词: 安捷伦科技 , 测序靶向序列捕获系统 , 定制试剂盒
安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出用于新一代测序(NGS) SureSelect XT 靶向序列捕获系统的最新定制试剂盒,该试剂盒可捕获高达 34 Mb 的目标基因组区域。

新版定制试剂盒的序列覆盖范围比旧版扩展了 5 倍,这使得研究人员能够将研究范围从人类外显子扩展到对动物、微生物、植物及其它生物体中较大的目标区域进行测序,目前尚没有针对此类研究的商业化预定义或目录版的靶向序列捕获试剂盒。

现在研究人员可以利用目录试剂盒或定制试剂盒对高达 34 Mb 的序列进行研究,这种撒大网的方式有利于发现 SNP、插入/缺失以及拷贝数变异。然后他们可以设计有针对性的自定义序列捕获文库,用于后续的大量样品研究。安捷伦提供 eArray 在线靶向序列捕获和芯片设计工具,可帮助用户设计并订购 SureSelect XT 定制版靶向序列捕获试剂盒(可选 10 到 5000 次反应,及适用于各种主流 NGS 平台的格式)。

安捷伦 SureSelect 平台市场总监 Fred P. Ernani 博士说:“安捷伦在定制长链寡核苷酸制造方面的出众能力再加上 eArray 设计工具的强大功能,能够为研究人员带来卓越的具有高度灵活性且可定制的 NGS 靶向序列捕获系统。现在,安捷伦能够为研究人员提供 200 Kb 到 34 Mb 的大范围定制捕获试剂盒,几乎适用于任何规模的研究。”

随着测序结果的不断产生,研究人员可以不断采用 SureSelect 和 eArray 工具反复进行快速设计和完善。现在,SureSelect XT 用户拥有全面的文库设计选择,从可直接使用的目录版试剂盒到结合了目录版和定制版内容的复合设计试剂盒,再到完全定制设计的试剂盒。

拥有DNA 靶向序列捕获和 RNA 靶向序列捕获的 SureSelect XT 产品线成为应用范围最广的新一代靶向测序技术平台。定制试剂盒的不断发展使得早期使用的客户能够捕获超过 60 Mb 的序列。

靶向序列捕获工作流程

靶向序列捕获使研究人员可以仅对目标基因组区域(而非整个基因组)进行测序,从而简化NGS工作流程。结合领先的新一代测序系统的更高速度,SureSelect XT 的多重检测支持功能使得研究人员在每次实验中都能更全面地认识更多样品的基因组,这在过去是难以实现的。文库制备和靶向序列捕获流程的瓶颈已经得到有效解决。

为进一步提高处理通量,安捷伦还提供了集成式工作站,用于自动化完成 SureSelect XT 文库制备和靶向序列捕获工作流程。可针对多重测序对样品进行索引,且所有试剂都适合自动化操作。不久之后,安捷伦的 Bravo 自动化液体处理系统所支持的自动化方案将增加 RNA 捕获自动化统包方案。

SureSelect 靶向序列捕获平台作为基因发现的核心工具,现已被 50 多篇同行评审的论文所引用。《科学》杂志 12 月 17 日刊登的 2010 年十大科学突破中,其中两项突破“Reading the Neandertal Genome”(解读尼安德特人基因组)和“Homing In on Errant Genes”(外显子组测序/罕见疾病基因)均采用了本系统。
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